23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2486 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  55.33 
 
 		 211 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  49.49 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  44.44 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  33.33 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  32.2 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  33.17 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  34.47 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  34.21 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  34.03 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  30.89 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  31.5 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  30.81 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  29.61 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  29.95 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  33.09 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  25.47 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  29.5 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>