25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1407 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  248  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  73.21 
 
 		 116 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  68.81 
 
 		 111 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  64.81 
 
 		 114 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  67.89 
 
 		 114 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  69.44 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  66.98 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.21 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.96 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  47.71 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  55.56 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  45.87 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  53.19 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  50 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  40.7 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  39.76 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  32.94 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  38.64 
 
 		 582 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  39.71 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  33.72 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  31.33 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  32.94 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>