36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1314 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 181 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  67.23 
 
 		 180 aa  261  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.3 
 
 		 181 aa  256  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.19 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.75 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  64.64 
 
 		 181 aa  251  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  64.09 
 
 		 183 aa  250  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  64.64 
 
 		 181 aa  248  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  64.64 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.22 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.89 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.34 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.31 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  56.42 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  54.75 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.87 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  54.95 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  49.73 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  48.07 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  43.58 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  42.08 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.83 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.81 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.97 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  35.58 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.12 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  27.12 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3568  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.41 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.23 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  28.04 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0205  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.77 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>