More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1309 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  36.93 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2191  hypothetical protein  32.68 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0041  quinone methlytransferase  40.4 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000105816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0133  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1711  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.51 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.86 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.78 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.52 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  30.46 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.97 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.66 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  34.48 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  42 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  36.36 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  38.38 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.45 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.34 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  35.85 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  33.04 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  31.78 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.81 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  31.78 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  29.09 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.45 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.66 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.36 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  25.14 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.57 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  29.09 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.73 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  28.18 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  29.09 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.89 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 354 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  27.11 
 
 		 353 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  30.36 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  27.11 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 349 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  28.65 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 348 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  33.65 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.9 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  37.25 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  37.25 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  37.25 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  30.36 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  37.25 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.36 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  37.25 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  29.94 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.1 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>