More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1224 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 421 aa  838    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  44.05 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 402 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  28.38 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  28.2 
 
 		 381 aa  150  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 323 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.42 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  26.37 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.61 
 
 		 311 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  21.68 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.33 
 
 		 303 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 309 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  26.07 
 
 		 298 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 308 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 307 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  26.44 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25.36 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.36 
 
 		 297 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.36 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  27.16 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25.36 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  25.36 
 
 		 297 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 301 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  29.79 
 
 		 308 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  27.76 
 
 		 296 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 293 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 310 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  27.98 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.64 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  24.3 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  27.37 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  27.02 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  24.91 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  27.02 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  27.37 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  27.37 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  27.37 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  27.37 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  23.99 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  27.37 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  23.21 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  28.18 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  27.02 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  30.83 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  25.22 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  28.38 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  25.48 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  23.93 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  25.45 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  25.69 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.35 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  25.69 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  24.13 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.22 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  32.88 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  25.42 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.74 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  23.87 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.09 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>