200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3267 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3267  microcompartments protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.820154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4893  microcompartments protein  61.99 
 
 		 183 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1427  microcompartments protein  41.99 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.295339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  56.82 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  53.85 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  53.12 
 
 		 102 aa  98.6  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  59.04 
 
 		 96 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  59.04 
 
 		 97 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  55.81 
 
 		 99 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  51.02 
 
 		 115 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  57.83 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  56.98 
 
 		 107 aa  95.5  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  56.98 
 
 		 103 aa  95.5  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  47.46 
 
 		 110 aa  95.1  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  56.98 
 
 		 103 aa  95.1  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  55.42 
 
 		 190 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  55.81 
 
 		 124 aa  95.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  55.42 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  53.49 
 
 		 178 aa  94.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  55.42 
 
 		 182 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  55.81 
 
 		 112 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  55.81 
 
 		 112 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  55.81 
 
 		 98 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  55.81 
 
 		 100 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  60 
 
 		 99 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  54.65 
 
 		 101 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  54.65 
 
 		 98 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  55.81 
 
 		 98 aa  93.2  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  50.52 
 
 		 97 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  54.65 
 
 		 99 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  55.81 
 
 		 98 aa  93.2  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  54.65 
 
 		 98 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  54.65 
 
 		 98 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  52.87 
 
 		 174 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  49.48 
 
 		 97 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  53.49 
 
 		 113 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  55.17 
 
 		 96 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  56.67 
 
 		 95 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  53.49 
 
 		 112 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  53.49 
 
 		 113 aa  92  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  53.49 
 
 		 99 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  50 
 
 		 99 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  52.33 
 
 		 104 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  60 
 
 		 92 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  56.82 
 
 		 91 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  60.71 
 
 		 94 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  56.82 
 
 		 97 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  53.75 
 
 		 91 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  59.52 
 
 		 94 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  53 
 
 		 96 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  52.87 
 
 		 93 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2648  major carboxysome shell protein 1A (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  51.81 
 
 		 98 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  47.13 
 
 		 100 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  57.65 
 
 		 91 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0358  microcompartments protein  55.95 
 
 		 92 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  55.95 
 
 		 95 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  56.32 
 
 		 164 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  55.17 
 
 		 96 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  55.95 
 
 		 96 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  56.63 
 
 		 96 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  58.14 
 
 		 105 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  55.29 
 
 		 104 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  58.33 
 
 		 94 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  56.32 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  52.87 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  54.02 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  53.49 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  55.17 
 
 		 93 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  49.43 
 
 		 96 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  54.35 
 
 		 106 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  50.57 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  50 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  48.28 
 
 		 96 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  50.54 
 
 		 94 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  51.72 
 
 		 94 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  52.87 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  51.72 
 
 		 94 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0894  ethanolamine utilization protein  48.86 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  51.72 
 
 		 94 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  54.02 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  51.72 
 
 		 94 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  52.87 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  51.72 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  52.87 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  51.72 
 
 		 111 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>