152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2278 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  100 
 
 
396 aa  825    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  49.43 
 
 
397 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  48.47 
 
 
392 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  41.92 
 
 
392 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.69 
 
 
429 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  36.67 
 
 
330 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  38.06 
 
 
450 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  36.06 
 
 
395 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  37.03 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  31.59 
 
 
422 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  32.59 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  34.97 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  30.25 
 
 
379 aa  176  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  33.33 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  32 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  31.67 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  28.53 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  35.69 
 
 
483 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  31.71 
 
 
388 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  32.82 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  37.45 
 
 
418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.82 
 
 
455 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  31.79 
 
 
404 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  31.79 
 
 
404 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  33.33 
 
 
403 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  30.87 
 
 
329 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.94 
 
 
361 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  30.12 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.18 
 
 
493 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.18 
 
 
493 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.65 
 
 
464 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.88 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  29.88 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.12 
 
 
474 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  31.15 
 
 
420 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.52 
 
 
447 aa  115  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.33 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  30.92 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.27 
 
 
415 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.6 
 
 
369 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.84 
 
 
411 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  28.43 
 
 
503 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  31.84 
 
 
397 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.84 
 
 
356 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  25.08 
 
 
340 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2038  hypothetical protein  25.97 
 
 
420 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000700253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  26.13 
 
 
365 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.83 
 
 
383 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  25.94 
 
 
536 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.28 
 
 
440 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1500  hypothetical protein  27.03 
 
 
435 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  28.2 
 
 
374 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  26.76 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.74 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  25.89 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  25.41 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.56 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  25.17 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  25.65 
 
 
367 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  29.87 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  25.31 
 
 
367 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.85 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.94 
 
 
314 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  26.59 
 
 
377 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  26.89 
 
 
431 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  26.82 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  25.72 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  25.72 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  25.4 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.47 
 
 
588 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  25.08 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  28.79 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  25.4 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.62 
 
 
379 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  25.32 
 
 
367 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.27 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  27.08 
 
 
351 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.86 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  27.76 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.18 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.06 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  25.37 
 
 
710 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  26.88 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  29.01 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  25.08 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  28.63 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.55 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  23.72 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  26.55 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  22.65 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  24.33 
 
 
712 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2035  CapA family protein  24.29 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0211653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  26.1 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.8 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.73 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  24.89 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.38 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  21.21 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  25.54 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0806  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.18 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>