22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3269 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  154  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  73.68 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  56 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  50.68 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  39.44 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  43.66 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  35.53 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  34.67 
 
 
127 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  41.18 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  36.49 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  36.99 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  34.21 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  28.38 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  30.77 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  29.58 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  29.31 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  30.56 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  30.26 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>