24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1252 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 108 aa  214  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  43.16 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  43.94 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  43.04 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  33.33 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  30.68 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0669  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558725  normal  0.557112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  37.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  32.04 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  62.96 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  36.92 
 
 		 81 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  43.18 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  52.5 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>