30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2594 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  100 
 
 		 311 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  33.54 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  26.91 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  33.12 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  32.21 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  27.09 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  29.01 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  25.98 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  26.73 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  27.4 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  24.73 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  24.73 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  32.5 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  27.67 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  26.67 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  22.8 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  29.77 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  30 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  25.76 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  25.17 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  30.16 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  24.42 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  23.49 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  31.13 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  39.74 
 
 		 111 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  22.54 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  23.25 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>