149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2278 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  100 
 
 
537 aa  1098    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  46.07 
 
 
523 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  46.41 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  45 
 
 
510 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  45.99 
 
 
530 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  42.62 
 
 
560 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  41.79 
 
 
531 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  40.82 
 
 
544 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  41.48 
 
 
511 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  41.25 
 
 
541 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  43.65 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  45.26 
 
 
541 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  39.59 
 
 
530 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  42.24 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  41.43 
 
 
587 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  40.04 
 
 
540 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  39.67 
 
 
499 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  40.75 
 
 
519 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  40.51 
 
 
534 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  39.07 
 
 
537 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  39.92 
 
 
524 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  39.65 
 
 
524 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  41.04 
 
 
490 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  39.65 
 
 
524 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  39.42 
 
 
524 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  39.85 
 
 
524 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  40.16 
 
 
517 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  40.29 
 
 
558 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  39.22 
 
 
530 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  38.29 
 
 
520 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  44.9 
 
 
437 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  44.9 
 
 
437 aa  364  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  44.9 
 
 
437 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  35.1 
 
 
511 aa  358  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  39.05 
 
 
517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  37.26 
 
 
500 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  36.75 
 
 
500 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  36.94 
 
 
500 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  36.87 
 
 
500 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  36.68 
 
 
500 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  36.68 
 
 
500 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  36.68 
 
 
500 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  36.68 
 
 
500 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  39.34 
 
 
523 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  36.24 
 
 
500 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  36.64 
 
 
633 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  35.26 
 
 
589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  36.47 
 
 
488 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  37.75 
 
 
599 aa  336  7e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  35.04 
 
 
578 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  37.35 
 
 
534 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  36.97 
 
 
596 aa  326  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  36.13 
 
 
495 aa  322  8e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  38.26 
 
 
512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  38.1 
 
 
512 aa  320  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  41.93 
 
 
496 aa  319  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  35.07 
 
 
492 aa  319  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  35.07 
 
 
489 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  32.31 
 
 
592 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  35.87 
 
 
478 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  35.07 
 
 
492 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  35.87 
 
 
478 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  35.18 
 
 
502 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  35.07 
 
 
489 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  34.71 
 
 
515 aa  317  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  35.28 
 
 
492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  34.62 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  35.7 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  38 
 
 
512 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  38 
 
 
512 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  35.07 
 
 
492 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  38 
 
 
512 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  38 
 
 
512 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  33.8 
 
 
492 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  38 
 
 
512 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  38.41 
 
 
512 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  34.66 
 
 
492 aa  309  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  33.08 
 
 
622 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  35.67 
 
 
492 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  38.15 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  35.43 
 
 
504 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  35.06 
 
 
504 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  35.06 
 
 
512 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  33.97 
 
 
511 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  34.01 
 
 
531 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  34.81 
 
 
499 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  34.94 
 
 
499 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  31.08 
 
 
735 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  31.01 
 
 
747 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  34.31 
 
 
499 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  31.01 
 
 
747 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4563  GerA spore germination protein  32.13 
 
 
652 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  32.26 
 
 
754 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  31.77 
 
 
503 aa  263  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  31.41 
 
 
734 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  31.62 
 
 
773 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  34.1 
 
 
481 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  31.84 
 
 
754 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3408  GerA spore germination protein  31.97 
 
 
566 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  32.26 
 
 
455 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>