More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0841 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
263 aa  513  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.5 
 
 
260 aa  315  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.07 
 
 
260 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
279 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
270 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.24 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 
269 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.38 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
271 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
274 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
276 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
270 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  39.16 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
262 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
274 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
274 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
270 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
264 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
274 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
272 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
269 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
272 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
280 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
264 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
284 aa  141  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.06 
 
 
272 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
270 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
272 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.19 
 
 
270 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.58 
 
 
272 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.68 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.48 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.68 
 
 
272 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.74 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.8 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.79 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.41 
 
 
280 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  32 
 
 
274 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.03 
 
 
276 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
275 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.04 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.04 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04161  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.61 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04581  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.22 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.958879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.37 
 
 
278 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.31 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.95 
 
 
266 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
272 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  38.91 
 
 
313 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 
272 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
269 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.5 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
267 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.46 
 
 
270 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.48 
 
 
282 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  32.21 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
270 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
269 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
267 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.53 
 
 
267 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
263 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
269 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>