213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0298 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  100 
 
 
357 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  45.13 
 
 
349 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  45.24 
 
 
349 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  45.13 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  45.13 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  45.13 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  45.13 
 
 
349 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  44.84 
 
 
349 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  45.24 
 
 
349 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  44.94 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  44.64 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  44.64 
 
 
349 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  42.81 
 
 
343 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  42.81 
 
 
343 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  40.59 
 
 
345 aa  280  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  42.39 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  41.11 
 
 
342 aa  263  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  40.95 
 
 
340 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  41.54 
 
 
340 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  41.47 
 
 
398 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  38.33 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  41.18 
 
 
398 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  39.18 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  39.18 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  37.09 
 
 
344 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  38.78 
 
 
399 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  39.12 
 
 
396 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  37.79 
 
 
394 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  38.24 
 
 
405 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  41.18 
 
 
387 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  39.41 
 
 
394 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  39.29 
 
 
394 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  39.41 
 
 
394 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  40.23 
 
 
397 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  36.95 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  40.51 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  35.76 
 
 
371 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  40.06 
 
 
394 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  38.31 
 
 
392 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  39.39 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  35.67 
 
 
372 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  37.57 
 
 
387 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  35.06 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  31.4 
 
 
353 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  27 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  31.25 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  26.16 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  26.18 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  26.25 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  29.15 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  30.61 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  26.69 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  25.88 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  28.47 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  30 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  26.45 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  28.31 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  25.63 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  27.98 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  28.66 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  27.13 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  24.44 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  23.84 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  27.75 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  30.81 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  27.53 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  27.42 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1064  peptidase, putative, truncation  39.24 
 
 
86 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357611  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  31.22 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0501  Glutamyl aminopeptidase  23.93 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00911075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  22.62 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  27.3 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  25.94 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  28.16 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  28.23 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  26.67 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  28.21 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  27.5 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  26.98 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  27.13 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  27.08 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  27.54 
 
 
353 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.86 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  27.66 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  25.93 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  26.02 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1595  glutamyl aminopeptidase  25.24 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.505343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  29.51 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  25.77 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  26.67 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  30.85 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  25.08 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0609  peptidase M42 family protein  24.24 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467193  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  22.51 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  27.49 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3414  peptidase M42 family protein  27.27 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2113  peptidase M42  28.82 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0599  peptidase M42 family protein  25.63 
 
 
342 aa  59.7  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000044001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  26.13 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  27.75 
 
 
361 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>