26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5353 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  54.7 
 
 
129 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  52.46 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  50.82 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  124  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  51.3 
 
 
124 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  50.86 
 
 
126 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  51.38 
 
 
113 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  52.29 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  47.01 
 
 
142 aa  116  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  46.09 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  48.62 
 
 
139 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  43.27 
 
 
129 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  46.79 
 
 
113 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  38.14 
 
 
124 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  39.25 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  33.94 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  30.63 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  28.95 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  34.88 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  36.23 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  25.81 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>