56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4692 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  33.79 
 
 
313 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  33.9 
 
 
319 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  33.9 
 
 
319 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  38.43 
 
 
325 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  30.87 
 
 
317 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  38.43 
 
 
325 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  38.79 
 
 
312 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  38.67 
 
 
335 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  38.25 
 
 
311 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  38.53 
 
 
341 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  32.57 
 
 
311 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  35.53 
 
 
334 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  32.34 
 
 
316 aa  139  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  32.48 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  33.62 
 
 
320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  31.58 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  34.42 
 
 
336 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  35.21 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  34.27 
 
 
324 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  38.15 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  34.74 
 
 
339 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  30.77 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  30.32 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  34.23 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  35.21 
 
 
324 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  34.33 
 
 
321 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  36.62 
 
 
317 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  35.21 
 
 
316 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  35.21 
 
 
252 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  30.14 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  26.05 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  32.37 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  25.33 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  27.35 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  27.73 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  27.27 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  24.6 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  30.54 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  25.31 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  32.93 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  33.54 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  35.19 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  28.99 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  32.82 
 
 
134 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  25.43 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  24.62 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  23.85 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  28.21 
 
 
211 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  28.81 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  29.75 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  27.12 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  23.26 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>