More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4670 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  66.38 
 
 		 458 aa  649    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 458 aa  960    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  65.35 
 
 		 459 aa  649    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  52.63 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  49.89 
 
 		 455 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  49.89 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  49.67 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  49.23 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  46.26 
 
 		 455 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  45.81 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  47.24 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  46.48 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  46.2 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  44.74 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  46.1 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  44.59 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  44.37 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  42.83 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  44.47 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  46.8 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  42.7 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  42.55 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  42.46 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  45.14 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  44.27 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  45.14 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  42.89 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  44.62 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  42.27 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  42.27 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  42.27 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  44.26 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  40.53 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  43.98 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  41.14 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  39.17 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  40.5 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  40.87 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  38.83 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  36.89 
 
 		 535 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  37.9 
 
 		 466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  37.9 
 
 		 466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  37.9 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  35.29 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  35.81 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  33.71 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  33.04 
 
 		 482 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  31.47 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  31.95 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  32.73 
 
 		 458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 471 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  33.49 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.45 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  31.95 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  36.1 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  31.45 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.99 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  34.97 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  32.21 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  31.77 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 		 447 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.79 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  32.46 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  34.45 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  34.29 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  34.54 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.9 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  30.89 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  31.38 
 
 		 461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  33.95 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.72 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.99 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  34.62 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  30.97 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  31.57 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.42 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  30.3 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.42 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  32.51 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  32.21 
 
 		 440 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  34.4 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.25 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  34.47 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  32.89 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  35 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  30.93 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  31.39 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  34.21 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.16 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  29.82 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.59 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  34.47 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>