More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2832 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  61.28 
 
 
700 aa  895    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  61.13 
 
 
688 aa  849    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  52.77 
 
 
658 aa  702    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  100 
 
 
686 aa  1426    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.6 
 
 
626 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40885  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.25 
 
 
713 aa  258  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45509  predicted protein  28.19 
 
 
723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.25219  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33475  predicted protein  29.14 
 
 
699 aa  240  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0672097  normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02550  NAD+ synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.96 
 
 
652 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08203  glutamine dependent NAD synthetase (Eurofung)  27.4 
 
 
678 aa  201  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0452691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  26.34 
 
 
587 aa  188  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  26.7 
 
 
576 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  25.41 
 
 
647 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  25.48 
 
 
647 aa  177  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  26.84 
 
 
576 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  25.39 
 
 
573 aa  173  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  24.73 
 
 
545 aa  173  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  24.73 
 
 
538 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  24.81 
 
 
577 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  24.93 
 
 
642 aa  168  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.46 
 
 
574 aa  167  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  25.64 
 
 
652 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  24.35 
 
 
542 aa  166  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.35 
 
 
542 aa  166  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.81 
 
 
566 aa  165  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  24.82 
 
 
567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  24.76 
 
 
583 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.83 
 
 
577 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  24.58 
 
 
575 aa  159  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.66 
 
 
566 aa  157  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  25.72 
 
 
599 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  24.38 
 
 
541 aa  157  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  24.36 
 
 
571 aa  157  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  25.26 
 
 
635 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  23.61 
 
 
556 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  26.35 
 
 
611 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  25.33 
 
 
561 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  25.85 
 
 
591 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  25.19 
 
 
635 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  25.33 
 
 
561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  23.78 
 
 
576 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.56 
 
 
543 aa  154  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  25.15 
 
 
561 aa  153  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  24.47 
 
 
540 aa  153  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  23.26 
 
 
539 aa  153  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  24.22 
 
 
540 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  24.3 
 
 
539 aa  152  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.34 
 
 
597 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  23.68 
 
 
545 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.51 
 
 
535 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  26.23 
 
 
582 aa  150  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  24.15 
 
 
553 aa  150  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  22.8 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.7 
 
 
591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  25.84 
 
 
556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.43 
 
 
566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  25.34 
 
 
571 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  24.96 
 
 
573 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.7 
 
 
577 aa  147  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  23.91 
 
 
561 aa  147  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  25.92 
 
 
690 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  24.59 
 
 
536 aa  147  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.47 
 
 
577 aa  147  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  24.89 
 
 
546 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  24.14 
 
 
584 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  25.19 
 
 
560 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  25.19 
 
 
567 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  24.52 
 
 
554 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  24.39 
 
 
536 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  25.76 
 
 
690 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  23.62 
 
 
564 aa  144  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  25.12 
 
 
577 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  25.99 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  23.68 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  26.2 
 
 
685 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  24.01 
 
 
552 aa  139  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  26.24 
 
 
598 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  24.01 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  23.85 
 
 
558 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  24.25 
 
 
564 aa  138  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  23.59 
 
 
561 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  24.81 
 
 
547 aa  138  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  23.59 
 
 
561 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  24.96 
 
 
644 aa  137  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  25.64 
 
 
686 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  22.37 
 
 
538 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  23.88 
 
 
540 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  24.47 
 
 
583 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  25.77 
 
 
691 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  24.11 
 
 
550 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  24.55 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  24.57 
 
 
546 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  24.43 
 
 
645 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  23.82 
 
 
554 aa  135  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  24.64 
 
 
549 aa  134  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  25.93 
 
 
689 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  24.64 
 
 
549 aa  134  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  23.47 
 
 
540 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  23.47 
 
 
540 aa  133  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  23.92 
 
 
554 aa  133  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>