37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0984 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  100 
 
 
261 aa  517  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  47.22 
 
 
269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  38.15 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  36.28 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  38.43 
 
 
278 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  38.43 
 
 
278 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  38.43 
 
 
278 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  36.53 
 
 
265 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  36.44 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  35.59 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  31.92 
 
 
269 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  35.32 
 
 
262 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  33.64 
 
 
259 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  32.56 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  33.49 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  31.1 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  25.96 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  30.19 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0886  hypothetical protein  33.77 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0880  hypothetical protein  33.77 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0897  hypothetical protein  33.77 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864884  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  26.39 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  29.06 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  30.28 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  32.3 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  34.86 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  26.14 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  27.22 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  28.16 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  28.48 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  23.67 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  26.26 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  30.51 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>