17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2993 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  45.21 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4024  hypothetical protein  50.81 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  27.55 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  29.06 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  26.55 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  26.23 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  24.56 
 
 		 313 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  29.65 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2690  hypothetical protein  27.8 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  25.58 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  30.17 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  24.22 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  30.27 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  30.22 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  26.23 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  26.4 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>