298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0241 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0241  Polyphosphate kinase  100 
 
 		 699 aa  1439    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  41.1 
 
 		 687 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  40.32 
 
 		 679 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  37.84 
 
 		 659 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  35.21 
 
 		 695 aa  427  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  32.85 
 
 		 684 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  31.7 
 
 		 718 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  30.51 
 
 		 690 aa  362  9e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  31.19 
 
 		 696 aa  362  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  32.52 
 
 		 701 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  32.95 
 
 		 689 aa  359  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  31.09 
 
 		 701 aa  357  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  32.61 
 
 		 687 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  31.83 
 
 		 673 aa  356  7.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  31.9 
 
 		 689 aa  353  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  31.69 
 
 		 686 aa  352  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  350  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  30.78 
 
 		 690 aa  350  7e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  32.18 
 
 		 688 aa  349  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  31.81 
 
 		 709 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  31.22 
 
 		 694 aa  348  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  31.43 
 
 		 690 aa  347  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  31.69 
 
 		 687 aa  346  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  31.69 
 
 		 687 aa  346  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  31.69 
 
 		 687 aa  346  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  31 
 
 		 724 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  32.69 
 
 		 708 aa  344  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  31.78 
 
 		 692 aa  343  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  31.25 
 
 		 720 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  31.25 
 
 		 720 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  31.25 
 
 		 720 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  31.36 
 
 		 723 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  31.29 
 
 		 690 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  30.64 
 
 		 730 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  31.36 
 
 		 723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  31.69 
 
 		 720 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  31.36 
 
 		 723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  31.36 
 
 		 723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  31.75 
 
 		 688 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  31.75 
 
 		 688 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  31.75 
 
 		 688 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  31.75 
 
 		 688 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  31.75 
 
 		 688 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  31.59 
 
 		 681 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  32.1 
 
 		 708 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  28.9 
 
 		 722 aa  326  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  30.86 
 
 		 731 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  30.64 
 
 		 720 aa  323  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  30.88 
 
 		 715 aa  323  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  30.97 
 
 		 743 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  31.71 
 
 		 729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  32.79 
 
 		 702 aa  320  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  30.93 
 
 		 739 aa  320  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  32.79 
 
 		 702 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  28.65 
 
 		 695 aa  319  9e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  32.79 
 
 		 702 aa  319  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  32.79 
 
 		 702 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  30.82 
 
 		 712 aa  319  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  32.79 
 
 		 702 aa  319  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  30.14 
 
 		 693 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  32.79 
 
 		 702 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  31.25 
 
 		 731 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  32 
 
 		 702 aa  318  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  32.39 
 
 		 700 aa  317  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  31.19 
 
 		 696 aa  317  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  32.03 
 
 		 736 aa  316  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  29.64 
 
 		 715 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  31.91 
 
 		 721 aa  316  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  32.02 
 
 		 700 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  30.79 
 
 		 722 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  30.79 
 
 		 722 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  30.84 
 
 		 690 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  29.74 
 
 		 720 aa  313  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  31.12 
 
 		 728 aa  312  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  32.39 
 
 		 702 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  32.22 
 
 		 742 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  32.22 
 
 		 742 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  29.43 
 
 		 736 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  32.22 
 
 		 742 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  31.2 
 
 		 710 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  29.43 
 
 		 736 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  30.56 
 
 		 720 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  29 
 
 		 693 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  30.52 
 
 		 710 aa  310  5e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  32.64 
 
 		 702 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  31.16 
 
 		 737 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  30.63 
 
 		 693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  32.07 
 
 		 730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  32.16 
 
 		 743 aa  308  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  29.12 
 
 		 700 aa  308  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  29.94 
 
 		 746 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  29.94 
 
 		 747 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  30.9 
 
 		 700 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>