18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0119 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  26.11 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.35 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  27.85 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.48 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.52 
 
 		 145 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.09 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  39.47 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0925  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  29.1 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  36.23 
 
 		 133 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 377 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>