34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1955 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  100 
 
 		 1070 aa  2143    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1217 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  23.79 
 
 		 1191 aa  188  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1095 aa  159  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.95 
 
 		 699 aa  76.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  21.88 
 
 		 701 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.69 
 
 		 747 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  23.47 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25 
 
 		 893 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  22.14 
 
 		 812 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.39 
 
 		 740 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  21.11 
 
 		 748 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  22.26 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.94 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  20.56 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  21.01 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  21.07 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  21.18 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  19.49 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  20.36 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  20.06 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  19.78 
 
 		 789 aa  53.5  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  20.66 
 
 		 711 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.01 
 
 		 741 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  20.65 
 
 		 1094 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  18.8 
 
 		 611 aa  50.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  21.4 
 
 		 640 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.33 
 
 		 654 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.01 
 
 		 646 aa  47.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  21.08 
 
 		 606 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  19.86 
 
 		 794 aa  45.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  20.89 
 
 		 645 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  20.58 
 
 		 606 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.9 
 
 		 797 aa  44.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>