More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1204 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  80.54 
 
 		 185 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  75.68 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  71.89 
 
 		 185 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  61.96 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  54.59 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  52.72 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  50.83 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  53.26 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  50.28 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  50.28 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  48.11 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  48.62 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  51.09 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  46.49 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  45.95 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  45.81 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  45.41 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  45.41 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  46.49 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  48.37 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  44.51 
 
 		 211 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  45.41 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  46.2 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  48.39 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  46.49 
 
 		 187 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  177  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  44.57 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  44.02 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  41.85 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  45.65 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  44.86 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  45.65 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  48.91 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  42.62 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  42.93 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  42.62 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  43.48 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  43.78 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  45.65 
 
 		 187 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  169  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  44.81 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  47.54 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  42.31 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  44.02 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>