More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_R0075 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0052  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 114 bp  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0075  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 98 bp  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 64 bp  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  93.59 
 
 		 115 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  93.59 
 
 		 115 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  93.59 
 
 		 115 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  93.59 
 
 		 115 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 123 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 123 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 123 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 128 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 123 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  91.11 
 
 		 123 bp  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0012  5S ribosomal RNA  91.8 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0055  5S ribosomal RNA  91.8 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0036  5S ribosomal RNA  91.8 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0011  5S ribosomal RNA  91.8 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0054  5S ribosomal RNA  91.8 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0037  5S ribosomal RNA  91.8 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  90.77 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 110 bp  67.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  93.48 
 
 		 110 bp  67.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 110 bp  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 124 bp  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 129 bp  60  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 129 bp  60  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 129 bp  60  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 116 bp  58  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 116 bp  58  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 117 bp  54  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 113 bp  54  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 113 bp  54  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 114 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4293  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4357  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_r01  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0006  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0054  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0061  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0067  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 118 bp  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>