44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3418 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  246  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  91.13 
 
 		 165 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  87.1 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  76.27 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  81.98 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  76.99 
 
 		 156 aa  156  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  69.3 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  68.47 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  65.52 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  63.79 
 
 		 188 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  64.22 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  64.15 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  47.58 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  63.39 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  40.62 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  51.89 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  54.9 
 
 		 186 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  50.41 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  45.74 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  46.61 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  37.82 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  35.4 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  31.07 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  32.32 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  40.24 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  28.45 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  35.87 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  35.16 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  37.04 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  33.7 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  29.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  32.05 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  26.85 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  35.9 
 
 		 154 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>