121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3265 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3265  putative propanediol utilization protein PduT  100 
 
 		 183 aa  357  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1371  microcompartments protein  66.67 
 
 		 183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1303  microcompartments protein  54.14 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0360  microcompartments protein  49.15 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0085  microcompartments protein  47.75 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2231  polyhedral body protein  42.22 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2390  polyhedral body protein  42.22 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2277  polyhedral body protein  41.67 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0109336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2224  polyhedral body protein  41.67 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0143783  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2177  polyhedral body protein  41.67 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4895  microcompartments protein  50.28 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1916  microcompartments protein  44.75 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2056  microcompartments protein  46.2 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2295  propanediol utilization protein PduT  40.56 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  43.09 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3269  microcompartments protein  50.28 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.942262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0901  ethanolamine utilization protein  35.67 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1244  microcompartments protein  45.61 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2636  microcompartments protein  34.76 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1939  microcompartments protein  34.83 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3272  propanediol utilization protein (PduT)-like  39.66 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1366  microcompartments protein  35.56 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5812  microcompartments protein  31.05 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  41.86 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  32.07 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  44.3 
 
 		 96 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  45.12 
 
 		 96 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  41.18 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  40 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  41.18 
 
 		 102 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  29.48 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  40 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  36.78 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2223  propanediol utilization protein (pduK)  37.35 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2269  propanediol utilization protein  37.35 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.41069  normal  0.047753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2382  propanediol utilization protein  37.35 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  44.3 
 
 		 96 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  41.18 
 
 		 114 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  41.18 
 
 		 114 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  36.78 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2216  polyhedral body protein  37.35 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  41.18 
 
 		 113 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2169  polyhedral body protein  37.35 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  43.21 
 
 		 93 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2287  propanediol utilization protein PduK  36.14 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  40 
 
 		 103 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  41.18 
 
 		 102 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  41.18 
 
 		 103 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  40 
 
 		 112 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  41.18 
 
 		 103 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  38.89 
 
 		 98 aa  47.8  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  40 
 
 		 103 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  38.04 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  34.1 
 
 		 262 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  37.78 
 
 		 98 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  37.89 
 
 		 102 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1415  microcompartments protein  43.37 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  36.78 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  34.48 
 
 		 101 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  36.78 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  34.29 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3758  microcompartments protein  35.29 
 
 		 103 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4709  microcompartments protein  35.29 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000189639  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  44.94 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  34.78 
 
 		 112 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  37.65 
 
 		 96 aa  45.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  37.08 
 
 		 99 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  34.29 
 
 		 112 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  36.96 
 
 		 107 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  37.65 
 
 		 97 aa  45.1  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  37.08 
 
 		 98 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  37.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  37.08 
 
 		 98 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  37.08 
 
 		 98 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  36.36 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  35.96 
 
 		 104 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  38.27 
 
 		 107 aa  44.7  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  38.27 
 
 		 103 aa  44.7  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  37.04 
 
 		 101 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  37.04 
 
 		 99 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  37.04 
 
 		 98 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  37.18 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  35.56 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  40.51 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  38.27 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  37.04 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  26.6 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  37.8 
 
 		 91 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  26.6 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>