More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2651 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2651  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
240 aa  474  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0430594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1257  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  85.71 
 
 
240 aa  380  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 
240 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 
240 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.83 
 
 
240 aa  287  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 
240 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5622  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.26 
 
 
240 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.660092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5750  amino acid ABC transporter permease  60.26 
 
 
240 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.26 
 
 
240 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.83 
 
 
240 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20911 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.46 
 
 
241 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.46 
 
 
241 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.79 
 
 
232 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7240  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  50.44 
 
 
256 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.55 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3872  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 
238 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.65 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4486  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.5 
 
 
232 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358946  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 
229 aa  174  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  40.62 
 
 
229 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
229 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 
229 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
243 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
237 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 
229 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
229 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.18 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
267 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5068  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.25 
 
 
240 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458442  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.39 
 
 
246 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1440  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.64 
 
 
371 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.22 
 
 
240 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  41.83 
 
 
244 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
240 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  36.64 
 
 
267 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  37.45 
 
 
246 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  41.24 
 
 
229 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  36.53 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  37.04 
 
 
246 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  36.53 
 
 
229 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
229 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  36.63 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5003  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  36.21 
 
 
240 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  38.36 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.36 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.36 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0174  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
241 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.9 
 
 
229 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.31 
 
 
230 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
229 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
229 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
229 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  40 
 
 
231 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  39.74 
 
 
231 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  36.07 
 
 
229 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
229 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
229 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 
237 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
225 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 
225 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1453  amino acid ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
260 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  39.37 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26230  histidine transport system permease protein  38.53 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0832582  normal  0.643473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2927  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  38.53 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  40.09 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.32 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2857  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.224945  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
239 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  36.36 
 
 
239 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  36.32 
 
 
228 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  36.32 
 
 
228 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2853  histidine transport system permease protein  39.11 
 
 
229 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.62 
 
 
268 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.11 
 
 
229 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
239 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
239 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  36.32 
 
 
228 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.32 
 
 
228 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2732  amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 
229 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  36.32 
 
 
228 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.87 
 
 
228 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 
228 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
229 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
228 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.21 
 
 
231 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  35.87 
 
 
228 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.76 
 
 
268 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>