34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0428 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  69.94 
 
 
506 aa  768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  84.42 
 
 
507 aa  887    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  83.04 
 
 
507 aa  892    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  73.57 
 
 
507 aa  805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  74.56 
 
 
507 aa  817    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  83.43 
 
 
507 aa  873    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  80.56 
 
 
505 aa  859    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  73.32 
 
 
506 aa  803    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  67.46 
 
 
504 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  79.45 
 
 
515 aa  830    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  78.17 
 
 
505 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  75.82 
 
 
505 aa  800    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1039    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  87.91 
 
 
505 aa  912    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  57.23 
 
 
512 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  55.86 
 
 
521 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  54.42 
 
 
503 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  53.83 
 
 
503 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  44.55 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  47.96 
 
 
514 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  45.14 
 
 
512 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  42.11 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  42.44 
 
 
512 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  42.86 
 
 
507 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  37.99 
 
 
521 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  36.02 
 
 
507 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  35.24 
 
 
500 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  72.5 
 
 
209 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  29.72 
 
 
521 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  28.38 
 
 
541 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  25.54 
 
 
544 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  19.25 
 
 
522 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  19.93 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  19.93 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>