More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2994 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2994  ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 117 aa  166  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0981  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0960905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 		 117 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  156  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  56.25 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 125 aa  129  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  55.36 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>