More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1629 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  70 
 
 		 163 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  68.94 
 
 		 162 aa  228  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 		 160 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 		 161 aa  217  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  64.97 
 
 		 235 aa  216  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  48.73 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  50.32 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  51.9 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  48.73 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  48.39 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  48.1 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>