285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2141 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  47.85 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  55.97 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  49.06 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  38.89 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  41.83 
 
 
178 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  40.26 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  39.61 
 
 
168 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  43.8 
 
 
179 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  40.61 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  38.78 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  39.29 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  34.27 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  30.97 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.74 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  34.72 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  34.72 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.6 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.49 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  30.57 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.2 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  30.82 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  36.5 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  36.5 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  36.5 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  35.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  34.19 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  34.29 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  32.08 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  34.29 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  32.35 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  30.32 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
238 aa  63.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  30.46 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  32.08 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>