34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3129 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  42.39 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  49.69 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  47.34 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  50.62 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  45.41 
 
 		 220 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  48.13 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  42.79 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  49.69 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  47.34 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  51.25 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  42.71 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  42.78 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  45.51 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  41.94 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  43.64 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  39.89 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  41.53 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  40.57 
 
 		 184 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  42.7 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  41.88 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  38.64 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  36 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  36.08 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  35.88 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  35.8 
 
 		 169 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 114 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  36.36 
 
 		 115 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  28.75 
 
 		 484 aa  42.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  35.06 
 
 		 97 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  31.17 
 
 		 115 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>