47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2064 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  209  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  56.12 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  57.43 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  60 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  40.66 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  47.19 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  43.18 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  42.7 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  39.33 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  33 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  32 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  44.29 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  33.65 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  37.04 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  40.7 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  36.71 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  35.53 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  37.84 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  34.15 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  30.26 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1172  hypothetical protein  29.59 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.91443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  32 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  30.56 
 
 		 125 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  31.17 
 
 		 131 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  31.07 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  30.1 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  29.41 
 
 		 109 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>