64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1670 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1670  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  47.37 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2268  hemerythrin-related protein  30.48 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.501223  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  32.54 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  32.54 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  33.61 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  33.05 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  34.44 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  27.34 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  30 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  34.35 
 
 		 360 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.05 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  30.53 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  26.72 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.25 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  27.27 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.77 
 
 		 779 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  28.81 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  28.46 
 
 		 631 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  30.95 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 		 941 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  28.81 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  27.69 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  36.36 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 		 997 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  27.82 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 		 722 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  23.44 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  32.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  30 
 
 		 519 aa  42  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  26.09 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  30.37 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.85 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0109  hypothetical protein  31.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 579 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  25.78 
 
 		 132 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  26.02 
 
 		 138 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  25.98 
 
 		 148 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 1032 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30.49 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 		 515 aa  40.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 138 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1653  hemerythrin-like metal-binding protein  26.88 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000451029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 		 515 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 		 736 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>