43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2268 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2268  hemerythrin-related protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.501223  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1670  hypothetical protein  30.48 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  29.52 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  34.07 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  33.73 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  35 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  30.3 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  35 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  27.66 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  32 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.28 
 
 		 941 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 615 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  32.88 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  29.67 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  32.93 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 736 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  33.33 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  36.59 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  27.37 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.46 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 722 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  34.09 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.19 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 518 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  32.29 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  26.19 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 927 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  34.29 
 
 		 722 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  32.89 
 
 		 519 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  28.4 
 
 		 137 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  24.39 
 
 		 667 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>