258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1565 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  100 
 
 
327 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  44.28 
 
 
301 aa  237  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  43.59 
 
 
299 aa  226  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  38.7 
 
 
298 aa  225  8e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  42.91 
 
 
300 aa  216  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  35.11 
 
 
272 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  33.77 
 
 
292 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  37.82 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  31.8 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  32.54 
 
 
301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  32.76 
 
 
285 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  34.63 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  32.91 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  30.58 
 
 
292 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  35.51 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  30.88 
 
 
287 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  31.77 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  36.14 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 
298 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  35.74 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  35.74 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  33.33 
 
 
302 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  33.48 
 
 
279 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.89 
 
 
281 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  29.84 
 
 
311 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  29.41 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  30.8 
 
 
283 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.1 
 
 
263 aa  116  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  34.21 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  29.8 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  30.07 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  30.07 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  29.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  30.77 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  32.58 
 
 
263 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.82 
 
 
470 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  28.86 
 
 
261 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  31.47 
 
 
259 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  31.47 
 
 
259 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  26.24 
 
 
261 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  30.71 
 
 
287 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  30.71 
 
 
287 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  30.71 
 
 
287 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  30.36 
 
 
287 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  30.36 
 
 
287 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  30.36 
 
 
287 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  30.36 
 
 
287 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  30.36 
 
 
287 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  30.36 
 
 
287 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  29.59 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  27.19 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  28.47 
 
 
284 aa  93.2  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  28.67 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.53 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  29.59 
 
 
287 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.76 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3015  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.26 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  28.24 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.36 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  29.35 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.35 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.59 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0717  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.17 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165472  normal  0.339839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.38 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.84 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.58 
 
 
444 aa  69.3  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.6 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.51 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.6 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  28.28 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.7 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4404  iron-sulfur cluster-binding protein  26.02 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.79 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  29.19 
 
 
480 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.64 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
837 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.04 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.51 
 
 
404 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0126  iron-sulfur cluster-binding protein  27.45 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2462  putative ferredoxin-type protein NapH  28.95 
 
 
281 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.51 
 
 
404 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  24.52 
 
 
386 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.53 
 
 
331 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1233  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.95 
 
 
407 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.668927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.56 
 
 
356 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.89 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.98 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.36 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.51 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.29 
 
 
841 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>