233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5958 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5958  PEBP family protein  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4694  PBP family phospholipid-binding protein  82.78 
 
 
211 aa  362  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2143  PEBP family protein  75.48 
 
 
210 aa  348  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1855  PEBP family protein  75.96 
 
 
210 aa  345  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0419  PBP family phospholipid-binding protein  67.76 
 
 
215 aa  303  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4061  protein of unknown function DUF524  67.3 
 
 
210 aa  293  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0478  PBP family phospholipid-binding protein  66.98 
 
 
215 aa  290  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  62.93 
 
 
209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  58.29 
 
 
212 aa  251  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0957  PEBP family protein  54.76 
 
 
209 aa  242  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0141  PEBP family protein  56.25 
 
 
208 aa  241  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  55.02 
 
 
208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6829  PEBP family protein  50 
 
 
212 aa  222  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03572  hypothetical protein  48.56 
 
 
203 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  49.04 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1305  PEBP family protein  43 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.234721  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1371  hypothetical protein  43 
 
 
204 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  33.17 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  35.96 
 
 
180 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  31.02 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  37.06 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  32.43 
 
 
180 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  30.2 
 
 
157 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  33.88 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  33.66 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  36.05 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  30.73 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  30.99 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  31.68 
 
 
181 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  34.13 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  30.92 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  33.68 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  27.59 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  32.56 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  30.92 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  29.27 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  30.43 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  32.97 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  35.09 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  31.4 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  31.4 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  30.05 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  30.05 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  30.05 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2599  PBP family phospholipid-binding protein  32.57 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0610588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  30.05 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  30.05 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  33.97 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2290  PEBP family protein  33.66 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  32.94 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  31.18 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  30.59 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  31.19 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  31.36 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  31.19 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  31.53 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5580  PEBP family protein  29.9 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  32.16 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  30 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  28.29 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  31.07 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  28.71 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  31.53 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  33 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  30.05 
 
 
175 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  28.29 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  30.81 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  31.19 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  33.33 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  33.94 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  30.86 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  29.35 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  26.83 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  31.03 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  31.61 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  31.4 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  32.56 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  28.22 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  28.4 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  30.23 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  29.21 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  29.06 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21340  phospholipid-binding protein, PBP family  29.9 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437018  normal  0.157291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  32.37 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  32.37 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  32.37 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  32.37 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  32.37 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  32.37 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>