More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4458 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  76.03 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  57.6 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  57.26 
 
 		 137 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2000  ferric uptake regulator, Fur family  54.55 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  43.8 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  49.18 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3626  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  43.9 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.39 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.4 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  27.41 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  29.84 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  27.87 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  25.55 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  38.02 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  28.33 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  28.33 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  28.33 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  28.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  28.33 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  31.45 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  29.03 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  26.05 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  26.05 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30.95 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  28 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  29.92 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30.95 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30.95 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  27.05 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  36.59 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  37.61 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.08 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  30.89 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  37.61 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.45 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  27.78 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  27.78 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  27.78 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  25.19 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.78 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  28.57 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.89 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  34.15 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.78 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.78 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  31.45 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>