41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2229 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  839    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  63.11 
 
 
425 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  61.95 
 
 
427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  57.14 
 
 
429 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  56.87 
 
 
429 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  58.54 
 
 
407 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  53.96 
 
 
427 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  62.14 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  52.15 
 
 
429 aa  342  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  42.37 
 
 
415 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  39.56 
 
 
415 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  31.28 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  31.05 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  29.91 
 
 
396 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  30.89 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  30.43 
 
 
396 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  30.43 
 
 
396 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  30.43 
 
 
396 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  30.43 
 
 
396 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  29.77 
 
 
395 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  29.77 
 
 
395 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  29.77 
 
 
395 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  30.43 
 
 
396 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  30.43 
 
 
396 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  31.4 
 
 
397 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  30.43 
 
 
396 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  30.47 
 
 
395 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  30.47 
 
 
397 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  31.4 
 
 
396 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  30.49 
 
 
397 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  32.38 
 
 
397 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  30.86 
 
 
396 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  28.53 
 
 
394 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  29.05 
 
 
404 aa  87  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  38.6 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  38.6 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  29.51 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  36.84 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  28.7 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  23.47 
 
 
424 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  33.59 
 
 
641 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>