51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1525 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  100 
 
 		 428 aa  880    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  68.27 
 
 		 407 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  65.44 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  60.85 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  46.17 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  45.05 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  45.19 
 
 		 475 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  44.7 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  43.93 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  43.78 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  43.78 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  44.7 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  44.82 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  40.91 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  44.7 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  42.93 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  44.97 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  43.92 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  44.42 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  39.76 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  44.79 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  42.42 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  39.73 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  40.21 
 
 		 425 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  42.16 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  40.2 
 
 		 426 aa  262  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  40.89 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  37.7 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  39.32 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  37.6 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  37.5 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  38.38 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  38.15 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  42.17 
 
 		 486 aa  235  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  33.48 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  39.26 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  32.62 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  38.24 
 
 		 420 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  37.57 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  24.31 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  25.3 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  22.42 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.19 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  22.64 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  26.15 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  24.65 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>