43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1391 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  227  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3022  hypothetical protein  74.23 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.536678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3741  hypothetical protein  74.23 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  66.15 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  45.45 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  40.95 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  49.28 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  39.47 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  44.57 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  40.62 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  35.07 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  39.77 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  35.07 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  38.54 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  44.59 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  40.22 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  40.22 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  40.22 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  40.22 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  40.22 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  40.22 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  40.22 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  44.59 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  44.59 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  40.7 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  36.63 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  36.63 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  40.45 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  39.47 
 
 		 522 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  28.71 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  35.58 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  44.93 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  47.62 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  32.91 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  42.47 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2270  putative signal peptide protein  46.94 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1947  signal peptide protein  47.92 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  0.055164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  29.73 
 
 		 275 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  33.91 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>