46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0978 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  100 
 
 
377 aa  761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  61.77 
 
 
379 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  62.74 
 
 
364 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3938  hypothetical protein  61.32 
 
 
180 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.158904  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  28.95 
 
 
353 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  31.82 
 
 
663 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  28.08 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  28.14 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  27.04 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  29.28 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  28.32 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  25.13 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  25.46 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  26.34 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  27.62 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  26.45 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28.13 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.73 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.06 
 
 
617 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  28.18 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.92 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.97 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.97 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.71 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.53 
 
 
597 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.85 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 
630 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  24.78 
 
 
597 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.07 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  23.86 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 
662 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  23.86 
 
 
309 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.77 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  25.61 
 
 
329 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  25.61 
 
 
329 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  21.58 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  23.01 
 
 
647 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 
628 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  24.52 
 
 
628 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  30.52 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>