40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0826 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  39.16 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  39.1 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  36.17 
 
 
205 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  38.57 
 
 
188 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  29.84 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  41.55 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  88.6  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  32.31 
 
 
254 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  27.46 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  38.33 
 
 
342 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  29.17 
 
 
276 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  37.41 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  36.89 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  33.05 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  28.47 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  33.61 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  29.6 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  27.01 
 
 
313 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  30.15 
 
 
260 aa  59.7  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  27.21 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  25.4 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  29.55 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  31.86 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  25.33 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  24.67 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  25.42 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  24.32 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  24.35 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  29.2 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  27.91 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  27.33 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  24.42 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  24.68 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  24.42 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  24.68 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  27.33 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  26.92 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  27.35 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  25.64 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>