52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4857 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4857  HNH endonuclease  100 
 
 
211 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  38.89 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  38.89 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  23.91 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  27.03 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  27.27 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  26.47 
 
 
182 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  31.71 
 
 
178 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  24.06 
 
 
169 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  27.27 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  30.23 
 
 
164 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  45.95 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  45.95 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  45.95 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  30.43 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  26.47 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  38.1 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  24.04 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.03 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  29.03 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  26.19 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  26.47 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  27.1 
 
 
81 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  23.57 
 
 
173 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  26.47 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  45.45 
 
 
552 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  45 
 
 
443 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  25 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  30.88 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  30.88 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  47.37 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  37.25 
 
 
80 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  37.25 
 
 
80 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  28.05 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  25.88 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.71 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  36.59 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  26.83 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  27.63 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  37.5 
 
 
198 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  26.5 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  28.68 
 
 
199 aa  42  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  30.88 
 
 
204 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  25.61 
 
 
165 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  25.61 
 
 
165 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  26.44 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  36.59 
 
 
139 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  21.92 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  28.74 
 
 
166 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  25.98 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  25.27 
 
 
168 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  40 
 
 
146 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>