42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1025 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  100 
 
 
322 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  48.79 
 
 
329 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  34.09 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  33.86 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  25.25 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  30.6 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.53 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  28.83 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  32.79 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  26.61 
 
 
325 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.61 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  31.11 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  38.52 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  25.64 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.49 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  29.85 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.53 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.89 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.07 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  28.63 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.11 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  25.51 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  27 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.65 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  29.77 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  36.26 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  39.29 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  35.63 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  22.83 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  31.97 
 
 
361 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  24.82 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0499  hypothetical protein  26.96 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  28.74 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.29 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  28 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  41.67 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  26.19 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  46.03 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  27.68 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  32.79 
 
 
311 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2891  hypothetical protein  44.07 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>