88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5057 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5057  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  100 
 
 
377 aa  788    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5056  beta-lactamase domain protein  55.76 
 
 
399 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5058  beta-lactamase domain protein  56.06 
 
 
396 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  23.47 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.56 
 
 
761 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  26.49 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  26.49 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.23 
 
 
773 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  26.49 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  26.49 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  26.49 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  26.49 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.88 
 
 
773 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  23.99 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.18 
 
 
682 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  27.42 
 
 
808 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  37.65 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  33.01 
 
 
747 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.58 
 
 
738 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.7 
 
 
773 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.62 
 
 
745 aa  53.9  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  24.45 
 
 
502 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1991  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.81 
 
 
740 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.66 
 
 
795 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  23.28 
 
 
795 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl369  DNA uptake protein  31.76 
 
 
607 aa  52.4  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.399e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.62 
 
 
737 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  36.25 
 
 
806 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  27.07 
 
 
825 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.07 
 
 
822 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.87 
 
 
726 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.87 
 
 
726 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
806 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 
771 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.49 
 
 
786 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  21.4 
 
 
451 aa  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  23.7 
 
 
461 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  23.33 
 
 
461 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  23.37 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.83 
 
 
883 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.9 
 
 
773 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.06 
 
 
758 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.882312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.83 
 
 
814 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25480  putative competence protein  33.87 
 
 
741 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  26.83 
 
 
979 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.39 
 
 
752 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  22.06 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.64 
 
 
796 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  24.25 
 
 
872 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  21.8 
 
 
320 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.84 
 
 
737 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.84 
 
 
738 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  23.33 
 
 
461 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  23.33 
 
 
461 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.63 
 
 
746 aa  46.2  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  22.88 
 
 
461 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.89 
 
 
722 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  27.71 
 
 
888 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14730  DNA internalization-related competence protein ComA  32.69 
 
 
711 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0603479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  24.15 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  23.22 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.23 
 
 
845 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  30.83 
 
 
737 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23 
 
 
780 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.27 
 
 
856 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  34.07 
 
 
738 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  22.59 
 
 
294 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  19.62 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  26.82 
 
 
291 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 
734 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 
842 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 
856 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 
856 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 
856 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.86 
 
 
842 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.6 
 
 
747 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>