152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3001 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  43 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  40.58 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  39.71 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  39.9 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  36.97 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  36.47 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  33.82 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  31.88 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  32.51 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  28.64 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  32.51 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  32.51 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  34.3 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  32.52 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  29.9 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  30.43 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  27.94 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  29.76 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  32.69 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  30.43 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  27.94 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  27.72 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  30.19 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  28.02 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  29.47 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  28.36 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  26.6 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  30.2 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  28.92 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  25.6 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  30.58 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  28.99 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  29.56 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  28.99 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  27.32 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  30.2 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  26.24 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  26.24 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  27.23 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  28.99 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.08 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  31.03 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  25.74 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  30.48 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  29.34 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  30.24 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  31.22 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  30.43 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  28.37 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  25.13 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  30.24 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  27.45 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  29.06 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  27.67 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  24.12 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  28.99 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  25.49 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  26.63 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  27.18 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  27.18 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  25.12 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  31.76 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  27.45 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  26.7 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  26.96 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  23.76 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  24.63 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  26.7 
 
 		 282 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  23.76 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  23.76 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  31.4 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  31.4 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  31.4 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  26.47 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  31.4 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  24.64 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  27.59 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>