More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1186 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 
311 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  47.23 
 
 
316 aa  268  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2298  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.87 
 
 
340 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0862  esterase/lipase  45.11 
 
 
432 aa  240  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.23 
 
 
301 aa  199  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  43.62 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.24 
 
 
309 aa  189  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.29 
 
 
376 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.98 
 
 
313 aa  188  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.15 
 
 
311 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  40.66 
 
 
309 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  42.98 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.16 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.16 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.16 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.44 
 
 
308 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.15 
 
 
320 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.08 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  41.92 
 
 
316 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  42.74 
 
 
328 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  40 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.8 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.05 
 
 
310 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.61 
 
 
311 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 
318 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.08 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.85 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.08 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.67 
 
 
307 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.26 
 
 
317 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  38.91 
 
 
312 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.17 
 
 
313 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 
319 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.2 
 
 
314 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  37.91 
 
 
317 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  37.7 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  41.67 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.57 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.05 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.64 
 
 
320 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.43 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.43 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.74 
 
 
370 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.44 
 
 
316 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  40.17 
 
 
353 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.87 
 
 
316 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.34 
 
 
308 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  38.77 
 
 
312 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 
310 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.98 
 
 
317 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.66 
 
 
309 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0155  esterase / lipase  40.82 
 
 
318 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  41.53 
 
 
320 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
312 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  36.93 
 
 
305 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  36.58 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.68 
 
 
308 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  37.65 
 
 
310 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.7 
 
 
315 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.14 
 
 
324 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.38 
 
 
292 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  34.96 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.6 
 
 
325 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.08 
 
 
628 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  37.7 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.43 
 
 
371 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.9 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  36.7 
 
 
331 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.57 
 
 
371 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0941  putative lipase  33.78 
 
 
327 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  36.25 
 
 
305 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  35.36 
 
 
319 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.83 
 
 
309 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.56 
 
 
320 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3316  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.29 
 
 
304 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0637  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.29 
 
 
304 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144121  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3486  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.71 
 
 
304 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0801  hypothetical protein  38.03 
 
 
304 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.14 
 
 
316 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.09 
 
 
311 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.42 
 
 
375 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  38.75 
 
 
318 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.31 
 
 
306 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  34.44 
 
 
320 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  34.46 
 
 
321 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  34.46 
 
 
321 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.04 
 
 
329 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  34.46 
 
 
321 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  34.46 
 
 
319 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  34.46 
 
 
319 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.61 
 
 
382 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.33 
 
 
310 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.02 
 
 
352 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  34.83 
 
 
352 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1460  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.05 
 
 
308 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3590  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.13 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.63 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.14 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4089  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.06 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.21 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>