123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0131 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  48.08 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  36.71 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  36.71 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  36 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  51.06 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  35 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  32.5 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  31.17 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  35.09 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  46 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  34.55 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  32.5 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3086  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105833  hitchhiker  0.00000121729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3071  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.828833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3034  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277158  normal  0.0299682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3003  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3191  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725964  normal  0.991334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  41.82 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  36.21 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  40.38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  40.38 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  38 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  40 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  40.38 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  30 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  35.85 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  35.85 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1973  acyl carrier protein  50 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00384561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1691  acyl carrier protein  50 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00116185  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  31.25 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  35.85 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2978  hypothetical protein  24.36 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  40.82 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  42 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  42 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  42 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  51.16 
 
 		 81 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 79 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2777  acyl carrier protein, putative  24.36 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  34.55 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  38 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  40.38 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  40.74 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>