More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1973 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1973  acyl carrier protein  100 
 
 		 76 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00384561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1691  acyl carrier protein  100 
 
 		 76 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00116185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  70.27 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  71.83 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 80 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  70 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 74 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  68.57 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  68.57 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  68.57 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  63.89 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  60 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 73 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 81 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 78 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  65.67 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 80 aa  84.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  60 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  57.97 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  57.14 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 78 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  54.93 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  52.11 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  52.11 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  58.57 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  59.42 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  53.52 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  54.29 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  55.71 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  54.93 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  57.97 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  55.71 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>